Isabelle Comyn-Wattiau est professeur des universités en informatique au CNAM depuis septembre 2002. Elle est professeur à l'ESSEC en systèmes d'information depuis 1988. À l'ESSEC, elle a dirigé le programme doctoral de 1998 à 1999. De 1999 à 2002, elle a été professeur à l'université de Cergy-Pontoise où elle a dirigé le département informatique et créé le second cycle d'informatique. Elle est titulaire d'un doctorat et d'une habilitation à diriger des recherches en informatique.